...识别marker+肿瘤分型+建模+关键基因验证!生信发文不得不看的经典思 ...
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发布时间：5小时前
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...分型+建模+关键基因验证!生信发文不得不看的经典思路!
利用降维和聚类分析，识别了肿瘤微环境中的15个seurat群，并将其分为七种细胞类型。对15个seurat簇进行差异表达分析，确定marker基因。利用HALLMARK数据库，结合各成纤维细胞中基因组变异评分，进行GSVA分析，揭示各亚型的特征。
5.9分生信文章,非肿瘤识别biomarker+泛癌分析,多疾病分析仍然火热!
验证PABPC1在AS与泛癌中的表达差异。使用BioGRID建立独立生物相互作用网络，发现多个对癌症发展不利的基因。反向验证显示，脑卒中样本与对照组间PABPC1表达差异显著。在乳腺浸润性癌、胆管癌、结肠腺癌、食管癌等中，PABPC1表达上调。TIMERV.2.0数据库分析显示PABPC1与免疫浸润呈正相关，且在某些肿瘤中与...
8+非肿瘤纯生信,过敏性鼻炎结合哮喘的双疾病分析识别biomarker,值得学习...
二、GO和KEGG分析。AR患者支气管上皮DEGs富集在炎症和免疫反应BP中。哮喘患者鼻上皮DEGs富集于负调控半胱氨酸型内肽酶活性BP中。KEGG分析显示，AR患者支气管上皮DEGs主要参与哮喘、细胞粘附分子等信号通路。三、关键基因验证表明CST1是上气道和下气道的生物标志物。CST1在上气道和下气道的表达水平均显著上调...
