差异基因筛选差异基因的方法
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发布时间:2024-10-20 13:55
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时间:2024-10-31 06:43
在生物研究中,筛选差异基因的方法多种多样,包括DD-PCR、GENE-FISHING、GENE CHIP和高通量测序等。让我们逐一了解一下这些技术的特点。
DDRT-PCR,或称mRNA差异显示聚合酶链式反应技术,结合了PCR和聚丙烯凝胶电泳技术,以及银染或放射性自显影等显色方法。其基本步骤包括:首先从两组平行材料中提取总RNA或mRNA,然后逆转录成cDNA,接着利用随机引物和锚定引物进行PCR扩增,通过电泳分离差异片段,最后通过克隆和测序筛选出差异基因。
GENE-FISHING技术则通过反转录PCR和两步法PCR(GeneFishing PCR)来检测表达差异。它避免了假阳性问题,且无需聚丙烯酰胺凝胶,只需琼脂凝胶即可。该技术的特点包括无假阳性和高特异度,以及成本效益高和重复性好。
基因芯片技术以固相基质上的基因探针检测样品与之的碱基互补,通过计算机分析得出基因表达信息。它包括芯片微列阵制备、样品制备、生物分子反应和信号检测四个阶段,制备方法有表面化学和组合化学。
高通量测序技术,尤其是第二代测序,如de novo sequencing、全基因组重测序、全转录组测序和小分子RNA测序,为基因组和转录组水平的研究提供了强大工具,能发现新的变异和功能信息。