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发布时间：2024-10-19 21:47
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时间：2024-11-18 07:10
撰写：Young Hearts 来源：小张聊科研平台的“科研讲坛”公众号，微信公众号搜索“科研讲坛”即可关注/扫描关注见文末
本文聚焦于一篇发表在Oncogene杂志上的研究，由柳满然教授团队完成。主题是长非编码RNA（LncRNAs）KB-1980E6.3，它在维持乳腺癌干细胞（BCSCs）的干细胞特性方面扮演着关键角色。以下文章将深入解析该研究的背景、内容、结论及其科研套路。
研究背景
乳腺癌是全球高发的癌症之一，根据GLOBOCAN的统计数据，年发病人数高达226万。其中，乳腺癌干细胞（BCSCs）因其强大的自我更新和多向分化能力，成为传统治疗难以清除的癌细胞群体。LncRNAs作为一类转录RNA，长度超过200个核苷酸，其功能重要性日益凸显。它们在*癌症相关的细胞过程（如增殖、侵袭、迁移、凋亡）中发挥关键作用。
本文研究团队发现了一种新的缺氧性LncRNA KB-1980E6.3，它与乳腺癌预后不良相关联，能够通过与IGF2BP1结合，增加c-Myc mRNA的稳定性，从而维持BCSCs的干细胞特性。
研究内容
1. LncRNA KB-1980E6.3与乳腺癌预后
研究团队通过RNA-seq分析，识别了在缺氧条件下上调的LncRNAs，其中KB-1980E6.3-001显著增加。该LncRNA在多个缺氧性乳腺癌细胞中验证了其上调趋势，并且与乳腺癌组织中较高的表达水平和不良预后相关联。
2. LncRNA KB-1980E6.3维持BCSCs特性
通过构建LncRNA KB-1980E6.3稳定表达或敲低的细胞株，研究发现其能够显著影响BCSCs的干细胞特性，特别在维持细胞的自我更新和多能性上发挥作用。缺氧环境下，LncRNA KB-1980E6.3的上调促进了细胞球体形成能力。
3. LncRNA KB-1980E6.3*c-Myc蛋白水平
研究团队进一步揭示了LncRNA KB-1980E6.3通过调节c-Myc mRNA的稳定性，从而增加c-Myc蛋白水平的机制。这表明LncRNA KB-1980E6.3可能通过c-Myc途径影响BCSCs的维持。
4. LncRNA KB-1980E6.3与IGF2BP1结合
通过生物信息学工具预测，研究者发现LncRNA KB-1980E6.3可能与RNA结合蛋白IGF2BP1相互作用，进而*c-Myc mRNA的稳定性。实验验证了这一假设，揭示了LncRNA KB-1980E6.3通过与m6A读取器IGF2BP1结合来增加c-Myc mRNA的稳定性。
5. LncRNA KB-1980E6.3在肿瘤发生中的作用
研究进一步探讨了LncRNA KB-1980E6.3在体内肿瘤发生过程中的关键作用，发现其介导的c-Myc稳定性对于BCSCs的维持至关重要，从而导致肿瘤起始和生长。通过实验验证，揭示了缺氧诱导的LncRNA KB-1980E6.3/IGF2BP1/c-Myc轴在维持BCSCs特性、促进体内肿瘤发生中的核心功能。
科研套路总结
本文通过整合生物信息学数据库分析与生物实验，系统地验证了LncRNA KB-1980E6.3的功能。从基因筛选、功能验证到机制解析，研究思路清晰，步骤严谨，展示了LncRNA在乳腺癌生物学中的重要作用。该研究为寻找乳腺癌治疗的新靶点提供了理论依据和实验基础。
参考文献：
Zhu P, He F, Hou Y, Tu G, Li Q, Jin T, Zeng H, Qin Y, Wan X, Qiao Y, Qiu Y, Teng Y, Liu M. A novel hypoxic long noncoding RNA KB-1980E6.3 maintains breast cancer stem cell stemness via interacting with IGF2BP1 to facilitate c-Myc mRNA stability. Oncogene. 2021 Jan 19. doi: 10.1038/s41388-020-01638-9. Epub ahead of print. PMID: 33469161.
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