知道一个基因的全名,可以用工具查它的基因简写,基因符号吗
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发布时间：2022-05-04 15:21
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热心网友
时间：2022-06-23 13:24
知道一个基因的名称和ID，怎么查基因家族NC表示人类基因组DNA的RefSeq。（链接序列）NM表示mRNA的RefSeq。NP表示蛋白质的RefSeq查找基因的基本信息的方法如下:根据文献中已知的基因ID如果你在文献中看到你感兴趣的基因，而且文中还提到了基因在Genbank中的ID号，那就好了，直接打开在search后面的下拉框中选择Gene，然后在中间的文本框中输入基因名称“VEGF”，点击GO。搜索结果出来了，点击箭头所指的Limits,Limits的意思其实就是高级检索，你可以在这里对检索词进行很多*，这样能大大精简查询结果。我们接着来，在Limits这个界面，先选择查询的限定范围：先选Genename(基因名称)；然后再选择LimitbyTaxonomy（生物分类限定）中的Homosapiens（人类），然后再点击“GO”。直接点击基因名称“VEGFA”就可以看到有关基因的信息了。需要指出的是，在Genbank中，基因有很多别名（Aliases），和Genbank中记录的名称有可能不一致。比如在这里，VEGFA是Genbank中记录的基因名称，而它还有很多别名，比如MGC70609,VEGF（这就是我们要找的基因名称）,VEGF-A,VPF；还有，在这里可以看到该基因在染色体上的位置再往下看，可以看到Genomicregions,transcripts,andprocts，这里显示了该基因在基因组中的位置，以及转录本的生成情况：就看见了目的基因的mRNA的链接（如NM_001025366.1）和蛋白质的链接（如NP_001020537.2）这里得说两句，有的基因也许只有一个编码序列，但有的基因有很多的mRNA剪接体，但都是归在一个基因名称下面。比如，在VEGF基因下面有7个序列，分别是vascularendothelialgrowthfactorAisoforma,isoformc,isoformd,isoforme,isoformf,isoformg,isoformbprecursor，就需要根据查阅的文献以及在这些基因序列后面的解释来确定了。如果我想找的基因是第一个序列即isoforma,就可以点击NM_001025366.1，
