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知道一个基因的全名,可以用工具查它的基因简写,基因符号吗

发布网友 发布时间:2022-05-04 15:21

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热心网友 时间:2022-06-23 13:24

知道一个基因的名称和ID,怎么查基因家族NC表示人类基因组DNA的RefSeq。(链接序列)NM表示mRNA的RefSeq。NP表示蛋白质的RefSeq查找基因的基本信息的方法如下:根据文献中已知的基因ID如果你在文献中看到你感兴趣的基因,而且文中还提到了基因在Genbank中的ID号,那就好了,直接打开在search后面的下拉框中选择Gene,然后在中间的文本框中输入基因名称“VEGF”,点击GO。搜索结果出来了,点击箭头所指的Limits,Limits的意思其实就是高级检索,你可以在这里对检索词进行很多*,这样能大大精简查询结果。我们接着来,在Limits这个界面,先选择查询的限定范围:先选Genename(基因名称);然后再选择LimitbyTaxonomy(生物分类限定)中的Homosapiens(人类),然后再点击“GO”。直接点击基因名称“VEGFA”就可以看到有关基因的信息了。需要指出的是,在Genbank中,基因有很多别名(Aliases),和Genbank中记录的名称有可能不一致。比如在这里,VEGFA是Genbank中记录的基因名称,而它还有很多别名,比如MGC70609,VEGF(这就是我们要找的基因名称),VEGF-A,VPF;还有,在这里可以看到该基因在染色体上的位置再往下看,可以看到Genomicregions,transcripts,andprocts,这里显示了该基因在基因组中的位置,以及转录本的生成情况:就看见了目的基因的mRNA的链接(如NM_001025366.1)和蛋白质的链接(如NP_001020537.2)这里得说两句,有的基因也许只有一个编码序列,但有的基因有很多的mRNA剪接体,但都是归在一个基因名称下面。比如,在VEGF基因下面有7个序列,分别是vascularendothelialgrowthfactorAisoforma,isoformc,isoformd,isoforme,isoformf,isoformg,isoformbprecursor,就需要根据查阅的文献以及在这些基因序列后面的解释来确定了。如果我想找的基因是第一个序列即isoforma,就可以点击NM_001025366.1,
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