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卫星DNA的基本信息

发布网友 发布时间:2022-07-12 19:17

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热心网友 时间:2023-10-19 15:59

卫星DNA标记(microsatelliteDNA)是近十多年发展起来的一种新型的分子遗传标记。它具有数量大、分布广且均匀、多态信息含量高、检测快速方便等特点,已经被广泛应用于动、植物基因定位、连锁分析、血缘关系鉴定、遗传多样性评估、系统发生树构建、标记辅助选择等方面。
微卫星DNA又称短串联重复序列(shorttandemrepeat,STR)或简单重复序列(simplesequencerepeats,SSR),广泛随机地分布于真核生物基因组中,在DNA序列中平均每6kb就可能出现一个,约占人基因组的10%,其基本构成单位(核心序列)为1-6bp,呈串联重复排列而成。按核心序列碱基数不同可分别称为单二、三、四、五或六核苷酸,碱基组成分别有2(A/T,C/G),4(AC/TG,AG/TC,AT/TA,CG/GC)10,102和350种。人类基因组中以(CA/GT)n,简称(CA)n重复序列最多,总共约有5×104-105个,即平均每6-60kbDNA就存在一个(CA)n,重复次数约15~16次;相应地,大鼠平均为18kb,小鼠平均为16kb,绵羊平均65kb(Crawford等,1995)。与其它DNA多态标记一样,微卫星DNA呈孟德尔共显性方式遗传(Winter,1992)。
Weber(1990)按照重复结构的不同,把微卫星标记分为完全重复型(perfect)、不完全重复型(imperfect)和复合型(compound)三种。完全重复型指由不中断的重复单位构成的微卫星;不完全重复型指重复单位中间有3个以下的非重复碱基,且其两端不中断的部分重复数大于3;复合型指微卫星两端或两类以上的串联重复单位由不多于3个连续的非重复碱基分隔开,但各不中断的重复单位的重复数大于或等于5。
关于卫星的产生机理,多数学者认为是DNA复制和修复过程中的滑动错配或染色体减数*时姊妹染色单体不均等交换的结果(Tachida等,1992;Tautz等,1984),微卫星在基因组中的功能尚不清楚,已发现微卫星能参与遗传物质的结构改变,基因*及细胞分化等过程,有自身特异结合蛋白,尚能直接编码蛋白质,是一种非常活跃的碱基序列,微卫星核心序列是高度保守的,它与希氏大肠杆菌的Chi序列相似,揭示微卫星核心序列可能是与重组有关的蛋白质连接位点。微卫星可直接编码蛋白质,如脆性X综合症基因内(CGG)n串联重复,编码30个精氨酸;(CAG)n是人类基因库DNA序列外显子中发现最多的一种。另外,微卫星在促进染色体凝集,维持染色体结构等方面也有作用,可参与染色体折叠、染色体端粒形成等。(CA/GT)n、(GATA)n可能与致育性、性别分化、X染色体失活有关。

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