秋水仙素诱导多倍体的原理：在有丝分裂过程中，着丝点在分裂后期会自动分裂，两个染色单体分为两个染色体。纺锤丝的作用是将分裂的染色体拉向细胞两极，然后细胞中间自动形成细胞板，最后变成两个细胞。
使用秋水仙素后，纺锤丝的合成被抑制，在后期染色单体分裂后，没有纺锤丝，不能被拉向细胞两极，于是也不会形成细胞板，细胞就不分裂，最后就形成了染色体加倍的细胞。
诱导多倍体主要应用在育种方面，多倍体育种就是利用低温处理或用秋水仙素处理的方法，处理萌发的种子或幼苗，他们作用于正在进行细胞分裂的细胞。
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